Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5RAP3Q96JB5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5RAP3Q96JB5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms