Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCC12Q96J65 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms