Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms