Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4CQ96DT6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms