Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPSB1Q96BD6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms