Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RERGQ96A58 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms