Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSMEM1Q8WWF3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms