Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF3Q8TEJ3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms