Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACER1Q8TDN7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACER1Q8TDN7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACER1Q8TDN7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACER1Q8TDN7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACER1Q8TDN7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACER1Q8TDN7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACER1Q8TDN7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACER1Q8TDN7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACER1Q8TDN7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACER1Q8TDN7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER1Q8TDN7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms