Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CARMIL3Q8ND23 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms