Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC71LQ8N9Z2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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