Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC82Q8N4S0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC82Q8N4S0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms