Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZQ1

WDFY3, WD repeat and FYVE domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDFY3Q8IZQ1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDFY3Q8IZQ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms