Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC83Q8IWF9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms