Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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RAB11FIP4Q86YS3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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RAB11FIP4Q86YS3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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RAB11FIP4Q86YS3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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RAB11FIP4Q86YS3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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