Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALYREFQ86V81 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms