Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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UBE2Q1Q7Z7E8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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UBE2Q1Q7Z7E8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE2Q1Q7Z7E8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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