Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q71RC1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q71RC1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q71RC1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms