Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC141Q6ZP82 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms