Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF544Q6NX49 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms