Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms