Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms