Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CARMIL2Q6F5E8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CARMIL2Q6F5E8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms