Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZKSCAN2Q63HK3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZKSCAN2Q63HK3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms