Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECM29Q5VYK3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms