Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MALRD1Q5VYJ5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms