Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC18Q5T9S5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms