Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM41BQ5BJD5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM41BQ5BJD5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms