Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms