Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDLIM3Q53GG5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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