Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms