Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF212Q495C1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms