Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NBPF1Q3BBV0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NBPF1Q3BBV0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms