Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms