Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDO1Q16878 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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