Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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PTPRNQ16849 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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PTPRNQ16849 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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PTPRNQ16849 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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PTPRNQ16849 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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PTPRNQ16849 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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PTPRNQ16849 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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PTPRNQ16849 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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