Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms