Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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