Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FOXD1Q16676 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
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