Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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