Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMA4Q16363 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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