Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALX1Q15699 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALX1Q15699 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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