Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms