Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 MAN2B1-206ENST00000466794 3685 ntTSL 211.89□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 MAN2B1-202ENST00000433513 560 ntTSL 410.07□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 MAN2B1-215ENST00000596591 340 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 EIF4G1-227ENST00000455679 542 ntTSL 412.57□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SEMA4G-207ENST00000518244 652 ntTSL 319.17■□□□□ 0.662e-37■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.229e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.439e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.589e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 CHCHD6-207ENST00000514908 713 ntTSL 317.76■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 CHCHD6-202ENST00000503119 1148 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 CHCHD6-206ENST00000513253 690 ntTSL 310.96□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.647e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.519e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 PCCA-215ENST00000637657 2118 ntTSL 512.67□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 PCCA-211ENST00000636366 1654 ntTSL 59.99□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 PCCA-213ENST00000636475 1971 ntTSL 59.89□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 METTL22-201ENST00000163678 1510 ntTSL 1 (best)17.58■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 METTL22-216ENST00000568967 1672 ntTSL 216.79■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 LUZP1-204ENST00000471849 1190 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 METTL22-218ENST00000572956 706 ntTSL 311.98□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 METTL22-208ENST00000563501 519 ntTSL 510.47□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 METTL22-204ENST00000561993 656 ntTSL 26.78□□□□□ -1.325e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SORL1-210ENST00000532451 2165 ntTSL 1 (best)23.28■■□□□ 1.321e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-20■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.51e-20■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 29.9
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PCBP2Q15366 PRKAR1B-205ENST00000414568 752 ntTSL 515.86■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 IDS-206ENST00000466323 1529 ntTSL 1 (best)15.32■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 AC244197.3-204ENST00000427113 906 ntTSL 312.97□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 MRPL3-205ENST00000507669 848 ntTSL 312.87□□□□□ -0.351e-20■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 IDS-208ENST00000521702 572 ntTSL 511.43□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 AC244197.3-202ENST00000441880 416 ntTSL 29.62□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 AC244197.3-203ENST00000523759 742 ntTSL 37.61□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SIX5-202ENST00000560160 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.45■□□□□ 0.862e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 BYSL-203ENST00000475702 670 ntTSL 220.03■□□□□ 0.82e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-253ENST00000533471 556 ntTSL 419.74■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 BYSL-205ENST00000494032 572 ntTSL 219.12■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.542e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-220ENST00000527516 631 ntTSL 418.39■□□□□ 0.532e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 BYSL-204ENST00000489290 1153 ntTSL 317.67■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 29.9
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PCBP2Q15366 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 29.9
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PCBP2Q15366 DLAT-204ENST00000531306 1766 ntTSL 216.01■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 29.9
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PCBP2Q15366 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-210ENST00000526221 542 ntTSL 414.67□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 LRGUK-202ENST00000473068 583 ntTSL 214.45□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-245ENST00000532734 1412 ntTSL 513.72□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-205ENST00000526057 600 ntTSL 413.67□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-227ENST00000528527 940 ntTSL 513.01□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-226ENST00000528523 560 ntTSL 412.9□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-251ENST00000533225 583 ntTSL 512.9□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 TESK2-203ENST00000486676 3019 ntTSL 512.35□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ZNF528-AS1-201ENST00000594119 2732 nt12.21□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-260ENST00000534783 599 ntTSL 311.69□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-219ENST00000527510 571 ntTSL 411.35□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-255ENST00000533681 638 ntTSL 411.28□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 DLAT-202ENST00000393051 3517 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SORBS2-255ENST00000487836 723 ntTSL 211.21□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 DLAT-201ENST00000280346 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SORBS2-229ENST00000445625 759 ntTSL 511.14□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SORBS2-263ENST00000495932 556 ntTSL 410.92□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-228ENST00000529940 535 ntTSL 410.72□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SORBS2-264ENST00000498125 2096 ntTSL 510.45□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SORBS2-222ENST00000438278 871 ntTSL 510.28□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-252ENST00000533425 592 ntTSL 49.91□□□□□ -0.822e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 LRGUK-201ENST00000285928 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-218ENST00000527473 514 ntTSL 49.87□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 PDSS2-202ENST00000369037 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-254ENST00000533580 547 ntTSL 49.77□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 SORBS2-235ENST00000451974 873 ntTSL 59.65□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 29.9
PCBP2Q15366 ST5-213ENST00000526757 3019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 29.9
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