Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PCOLCEQ15113 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCOLCEQ15113 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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