Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAPTM4AQ15012 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms