Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCAPHQ15003 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCAPHQ15003 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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