Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD4Q14CM0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD4Q14CM0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms