Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCARF1Q14162 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCARF1Q14162 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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