Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CKAP5Q14008 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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CKAP5Q14008 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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CKAP5Q14008 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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